MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 chromosome

Total Repeats: 46397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009749	A	8	8	24	31	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
2	NC_009749	A	9	9	33	41	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
3	NC_009749	A	6	6	136	141	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
4	NC_009749	CAA	2	6	176	181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656467
5	NC_009749	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
6	NC_009749	TAA	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656467
7	NC_009749	A	6	6	226	231	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
8	NC_009749	A	6	6	242	247	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
9	NC_009749	T	7	7	282	288	0 %	100 %	0 %	0 %	169656467
10	NC_009749	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656467
11	NC_009749	AGA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
12	NC_009749	AGT	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656467
13	NC_009749	AAG	2	6	358	363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
14	NC_009749	TCA	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
15	NC_009749	AGA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
16	NC_009749	TGT	2	6	495	500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656467
17	NC_009749	AGC	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656467
18	NC_009749	TGG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169656467
19	NC_009749	GCAA	2	8	618	625	50 %	0 %	25 %	25 %	169656467
20	NC_009749	ATT	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
21	NC_009749	TTA	2	6	689	694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656467
22	NC_009749	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	169656467
23	NC_009749	TGAT	2	8	770	777	25 %	50 %	25 %	0 %	169656467
24	NC_009749	GAA	2	6	907	912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
25	NC_009749	A	6	6	994	999	100 %	0 %	0 %	0 %	169656467
26	NC_009749	CAG	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169656467
27	NC_009749	GTAC	2	8	1057	1064	25 %	25 %	25 %	25 %	169656467
28	NC_009749	TAC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
29	NC_009749	CTA	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169656467
30	NC_009749	GCTT	2	8	1153	1160	0 %	50 %	25 %	25 %	169656467
31	NC_009749	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	169656467
32	NC_009749	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656467
33	NC_009749	GTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169656467
34	NC_009749	AAG	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169656467
35	NC_009749	TGG	2	6	1359	1364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169656467
36	NC_009749	ATGC	2	8	1384	1391	25 %	25 %	25 %	25 %	169656467
37	NC_009749	GAT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656467
38	NC_009749	TAAA	2	8	1474	1481	75 %	25 %	0 %	0 %	169656467
39	NC_009749	A	6	6	1508	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	156501372
40	NC_009749	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
41	NC_009749	ATA	3	9	1625	1633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
42	NC_009749	AGTT	2	8	1686	1693	25 %	50 %	25 %	0 %	156501372
43	NC_009749	TGAT	2	8	1769	1776	25 %	50 %	25 %	0 %	156501372
44	NC_009749	TAA	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
45	NC_009749	AGCA	2	8	1883	1890	50 %	0 %	25 %	25 %	156501372
46	NC_009749	CAA	2	6	1906	1911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156501372
47	NC_009749	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501372
48	NC_009749	TAT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
49	NC_009749	ATG	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501372
50	NC_009749	CTA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156501372
51	NC_009749	A	7	7	2106	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	156501372
52	NC_009749	AGA	2	6	2148	2153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501372
53	NC_009749	ATA	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
54	NC_009749	ATT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
55	NC_009749	TAA	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
56	NC_009749	GAA	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501372
57	NC_009749	TCTA	2	8	2527	2534	25 %	50 %	0 %	25 %	156501372
58	NC_009749	ATA	2	6	2579	2584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501372
59	NC_009749	GTTT	2	8	2585	2592	0 %	75 %	25 %	0 %	156501372
60	NC_009749	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156501372
61	NC_009749	TAA	2	6	2618	2623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
62	NC_009749	GAAT	2	8	2661	2668	50 %	25 %	25 %	0 %	156501371
63	NC_009749	A	7	7	2680	2686	100 %	0 %	0 %	0 %	156501371
64	NC_009749	TA	3	6	2703	2708	50 %	50 %	0 %	0 %	156501371
65	NC_009749	AGT	3	9	2733	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501371
66	NC_009749	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
67	NC_009749	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	156501371
68	NC_009749	CAC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156501371
69	NC_009749	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	156501371
70	NC_009749	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156501371
71	NC_009749	T	6	6	2929	2934	0 %	100 %	0 %	0 %	156501371
72	NC_009749	ATA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156501371
73	NC_009749	T	6	6	2997	3002	0 %	100 %	0 %	0 %	156501371
74	NC_009749	ACC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156501371
75	NC_009749	AT	3	6	3022	3027	50 %	50 %	0 %	0 %	156501371
76	NC_009749	GAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156501371
77	NC_009749	TAT	2	6	3121	3126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169656468
78	NC_009749	T	7	7	3142	3148	0 %	100 %	0 %	0 %	169656468
79	NC_009749	ATA	2	6	3205	3210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169656468
80	NC_009749	TAG	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
81	NC_009749	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
82	NC_009749	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656468
83	NC_009749	CTT	3	9	3417	3425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
84	NC_009749	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	169656468
85	NC_009749	TA	3	6	3563	3568	50 %	50 %	0 %	0 %	169656468
86	NC_009749	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	169656468
87	NC_009749	T	7	7	3612	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	169656468
88	NC_009749	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
89	NC_009749	CTT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
90	NC_009749	GAT	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
91	NC_009749	TCAA	2	8	3734	3741	50 %	25 %	0 %	25 %	169656468
92	NC_009749	CAAC	2	8	3773	3780	50 %	0 %	0 %	50 %	169656468
93	NC_009749	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	169656468
94	NC_009749	AAC	2	6	3832	3837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169656468
95	NC_009749	A	6	6	3856	3861	100 %	0 %	0 %	0 %	169656468
96	NC_009749	CTT	2	6	3888	3893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169656468
97	NC_009749	ATTA	2	8	3901	3908	50 %	50 %	0 %	0 %	169656468
98	NC_009749	ATG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169656468
99	NC_009749	TTA	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009749	TAG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009749	GGT	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009749	TAC	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009749	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009749	GAT	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009749	TTA	2	6	4210	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009749	CAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009749	GT	3	6	4252	4257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009749	TGA	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009749	ATT	2	6	4307	4312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009749	TGTT	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009749	GGTA	2	8	4334	4341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009749	AT	3	6	4373	4378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009749	AAT	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009749	GGT	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009749	T	6	6	4576	4581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009749	TA	3	6	4590	4595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009749	TAG	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009749	ATT	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009749	GAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009749	TA	4	8	4758	4765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009749	CT	3	6	4779	4784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009749	T	6	6	4788	4793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009749	TTC	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009749	ATC	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009749	CAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009749	ATA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009749	ATTT	2	8	4974	4981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009749	TGG	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009749	GCA	2	6	5086	5091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009749	TTGA	2	8	5124	5131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009749	ACA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009749	TA	3	6	5237	5242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009749	TTTC	2	8	5261	5268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009749	TAG	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009749	TAA	2	6	5337	5342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009749	AGT	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009749	TTTA	2	8	5424	5431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009749	ATT	2	6	5439	5444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009749	ATTA	2	8	5490	5497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_009749	ATA	2	6	5540	5545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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